Caractérisation moléculaire des facteurs de virulences de Helicobacter pylori : fréquences, signes cliniques et traitements associés à une infection à H. pylori

Abstract

Contexte : Helicobacter pylori (H. pylori) est selon l’OMS un agent pathogène à priorité élevée pour la recherche et le développement de nouveaux antibiotiques. Plusieurs facteurs de virulences présumés tels que vacA, cagA et babA ont été identifiés comme contribuant au risque et à la gravité des maladies liées à H. pylori. L’objectif de notre étude était de déterminer les liens entre les signes cliniques associés à une infection à H. pylori, les traitements utilisés et les gènes vacA1 (sous types), vacA2, babA2 et cagA.

Méthodologie : 250 prélèvements de selles ont été collectés dans deux laboratoires de la ville de Ouagadougou, Burkina Faso, de Novembre 2020 à Janvier 2021. Les ADN bactériens ont été extraits et les facteurs de virulences de H. pylori ont été caractérisés par PCR.
Résultats : Le gène VacAi1 semblerait être lié à la présence des signes cliniques de l’infection à H. pylori avec p=0,05. Les sous-types des facteurs de virulences vacAs1, babA2 et cagA sembleraient liés à un échec des traitements d’éradications avec respectivement p=0,034 ; 0,027 et 0,025.

Conclusion : Les résultats suggèrent une association entre la présence du facteur de virulence vacAi1 et l’apparition des signes cliniques de l’infection par H. pylori.

English Title: Molecular Characterization of Helicobacter pylori Virulence Factors: Clinical Signs and Treatments Associated with Helicobacter pylori infection

Background: According to the WHO, Helicobacter pylori (H. pylori) is a high-priority pathogen for research and development of new antibiotics. Several putative virulence factors, such as vacA, cagA, and babA, have been identified as contributing to the risk and severity of H. pylori-related diseases. The aim of our study was to determine possible relationships between clinical signs associated with H. pylori infection, treatments used, and the vacA1 (subtypes), vacA2, babA2, and cagA genes.

Methodology: Two hundred and fifty (250) stool samples were collected at the two laboratory sites in Ouagadougou, Burkina Faso, from November 2020 to January 2021. A questionnaire form was completed for each sample. Bacterial DNA was extracted, and H. pylori virulence factors were characterized by PCR.

Results: The vacAi1 gene appeared to be linked to the presence of clinical signs of H. pylori infection, with p=0.05. The vacAs1, babA2, and cagA virulence factor subtypes appeared to be linked to the failure of eradication treatments with p=0.034; 0.027, and 0.025 respectively.

Conclusion: This study is one of the first of its kind in sub-Saharan Africa, particularly in Burkina Faso. The results suggest an association between the presence of the vacAi1 virulence factor and the onset of clinical signs of infection by H. pylori. This could lead to further studies to better understand this association.