Caractérisation de la diversité génétique des caféiers robusta (Coffea canephora L.) exploités au sud-est du Gabon à travers l’analyse par microsatellites des génotypes

Abstract

Description du sujet. La connaissance du matériel biologique exploité est un critère important pour la sélection et l’amélioration variétale, avec un regard absolu sur le respect de l’environnement. L’introduction des accessions caféières au Gabon date de plus de cinq décennies sans un intérêt précis sur l’identité des ressources phytogénétiques concernées.
Objectif. Cette étude vise la caractérisation phénotypique et génotypique des collections caféières dans la province du Haut-Ogooué, au sud-est du Gabon, afin de connaître la diversité du matériel végétal disponible dans ce bassin producteur.
Méthodes. La collecte de matériel végétal sur onze échantillons d’arbres (feuilles et cerises matures), présentant des dissemblances phénotypiques a été effectuée dans deux vergers : Alanga (Okondja) et Kélé (Franceville). Une première approche descriptive a été menée pour la caractérisation phénotypique en vue de situer les échantillons collectés dans l’un des groupes connus : guinéens ou congolais. Puis une analyse des organes foliaires par microsatellites grâce à l’analyse multivariée réalisée par le logiciel Darwin 6 a été menée pour apprécier les distances génétiques et identifier les génotypes des caféiers observés.
Résultats. Il ressort que les échantillons analysés couvrent une grande partie de la diversité potentielle de Coffea canephora L., en dehors du groupe dit « guinéen ». Cette situation se révèle remarquable et relativement rare, donc intéressante, dans une même plantation.
Conclusion. L’étude contribue à l’augmentation des connaissances sur les cultivars de caféiers robusta exploités au Gabon et elle entrevoit de bonnes perspectives de mise en place d’un programme national d’amélioration variétale des caféiers.

Description of the subject. The knowledge of genetic resources is one of the most important criteria of varietal selection and improvement. The introduction of coffee accessions has been made in Gabon for more than five decades without a specific interest on the identity of the plant genetic resources.
Objective. This study aims at characterizing the phenotype and genotype of coffee collections in Gabon, to know the diversity of plant material available in the southeast production basin.
Methods. The collection of plant material was made in two orchards on eleven samples of mature leaves and cherries, presenting phenotypic dissimilarities. A first descriptive approach was conducted for phenotypic characterization while microsatellite analysis using multivariate analysis was performed to assess genetic distances and identify the genotypes of coffee trees.
Results. Results showed a great diversity of Coffea canephora L., outside the so-called «Guinean» group. This situation is remarkable and relatively rare, so interesting, in the same plantation.
Conclusion. The study contributes to the increase of knowledge on robusta coffee cultivars exploited in Gabon and it foresees good prospects of setting up a national varietal improvement program for coffee.