Ampleur de la gastroenterite a rotavirus chez les enfants Togolais ages de moins de 5 ans

Abstract

Contexte: le rotavirus est la principale cause de gastroentérite sévère et de déshydratation chez l’enfant dans le monde. Le vaccin monovalent antirotavirus a été introduit dans le calendrier vaccinal du Togo depuis juin 2014. La disponibilité de données de base a permis d’examiner la charge de morbidité et de mortalité causée par le rotavirus chez les enfants togolais.

Méthode: nous avons effectué une étude cas-témoins à travers la surveillance sentinelle active de la gastroentérite aiguë et de la gastroentérite à rotavirus chez des enfants de moins de 5 ans au CHU Sylvanus Olympio et à l'Hôpital secondaire de Be à Lomé (Togo) d'octobre 2010 à septembre 2016, selon le protocole générique de l’OMS. Le rotavirus a été détecté dans les échantillons de selles par le test ELISA. La caractérisation des souches par génotypage a été réalisée au Noguchi Memorial Institute à Accra (Ghana) et au Medunsa campus à Pretoria (Afrique du Sud). Les cas testés rotavirus-positifs ont été comparés aux témoins testés rotavirus-négatifs.

Résultats: au cours des six années de la surveillance, 1409 enfants atteints de gastroentérite aiguë ont été enregistrés; et 692 (49%) ont été testés positifs pour le rotavirus. La différence d'âge entre les enfants atteints de gastroentérite à rotavirus et ceux atteints de gastroentérite non-rotavirus a été significative (p <0,001) ; les enfants atteints de gastroentérite à rotavirus ont été plus jeunes. De novembre à mars, les cas de gastroentérite à rotavirus (68%, p <0,002) ont été significativement plus nombreux que dans les autres mois de l'année. La déshydratation (p <0,05) a été plus fréquente chez les enfants atteints de gastroentérite à rotavirus que chez ceux atteints de gastroentérite non-rotavirus. Les combinaisons génotypiques les plus courantes ont été G12P [8] (29%), G1P [6] (16%), G1P [8] (13%), G3P [6] (6%) et G12P [6] (5%).

Conclusion: la prévalence du rotavirus a été élevée chez les enfants togolais ayant souffert de gastroentérite aiguë. La surveillance continue de la gastroentérite à rotavirus sera importante pour évaluer l'impact et l'efficacité du vaccin à travers un suivi des modifications dans l’évolution des tendances de la maladie.

Mots clés: gastroentérite, rotavirus, ampleur, Togo, Afrique sub-saharienne

English Title: Burden of acute gastroenteritis among Togolese children younger than 5 years of age

English Abstract

Background: Rotavirus is the leading cause of severe gastroenteritis and dehydration in young children worldwide. The monovalent rotavirus vaccine was introduced in Togolese immunization schedule since June 2014. The availability of baseline data has enable rotavirus disease burden examination among Togolese under-five year children.

Method: We conducted cases-controls study through active sentinel surveillance for acute gastroenteritis and rotavirus associated gastroenteritis among children <5 years of age at Sylvanus Olympio Teaching Hospital and Be Hospital in Lome (Togo) from October 2010 through September 2016, based on the World Health Organization’s generic protocol. Rotavirus was detected in stool specimens by ELISA. The strains characterization by genotyping was performed at Noguchi Memorial Institute for Medical Research in Accra (Ghana) and at Medunsa campus in Pretoria (South Africa). Laboratory-confirmed rotavirus cases were compared with rotavirus-negative controls.

Results: During the six-year surveillance, 1409 children with acute gastroenteritis were enrolled; and 692 (49%) were tested positive for rotavirus. The difference of age among children with rotavirus and non-rotavirus gastroenteritis was significant (p<0.001) with rotavirus cases younger than non-rotavirus cases. From November to March, significantly (68%, p<0.002) more cases of rotavirus gastroenteritis were enrolled compared with other months of the year. Dehydration (p<0.05) was more common in children with rotavirus than non-rotavirus gastroenteritis. The most common G-P combinations were G12P [8] (29%), G1P [6] (16%), G1P [8] (13%), G3P [6] (6%), and G12 P[6] (5%).

Conclusion: The prevalence of rotavirus is high among Togolese children with acute gastroenteritis. Continued rotavirus gastroenteritis surveillance will be important to evaluate vaccine impact and efficacy through monitoring of changes in rotavirus disease trends.

Keywords: gastroenteritis, rotavirus, burden, Togo, sub-Saharan Africa