Prévalence des entérobactéries productrices de bêtalactamases à spectre étendu isolées des hémocultures sur le continent Africain et les gènes impliqués chez les souches BLSE : revue de la littérature

Abstract

Introduction: Les entérobactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu ont été trouvées partout dans le monde. Des études de surveillance sont présentes en Europe, en Amérique, et en Asie, mais en Afrique, il n'y a pas eu de recherche récapitulative montrant la prévalence et la répartition de BLSE sur ce continent.

But: Cette revue de la littérature a pour but de décrire la prévalence des entérobactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu (E-BLSE) isolées des hémocultures en Afrique et les gènes BLSE impliqués dans la résistance.

Matériel et méthodes: Une recherche de la littérature a été effectuée sur PubMed. Les articles publiés sur le domaine entre 1996 et 2014 ont été examinés et lus en texte intégral dans le but d’observer l’intérêt et la pertinence de la publication. Dans notre contexte, les articles qui étaient pertinents ont été évalués et inclus dans l'étude.

Résultats: La prévalence des E-BLSE chez les patients hospitalisés et dans les communautés, varie largement entre les pays et pouvant atteindre souvent jusqu’à 77,8%. Plusieurs types d’échantillons ont été étudiés pour estimer la prévalence des EBLSE, mais le cas particulier des hémocultures reste vraiment limité. Les BLSE (classe  A et D) et AmpC plasmidique (pAmpC) ont régulièrement été trouvées, le gène CTXM- 15 de la classe A est prédominant sur le continent africain.

Conclusion: Les entérobactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu en milieux hospitaliers et communautaires sont courantes en Afrique. La majorité des études se sont réalisées au Nord et à l’Est, laissant presqu’un vide sur les autres parties du continent.

Mots-clés: Afrique ; Bêta-lactamases à spectre étendu ; Entérobactérie ; Hémoculture ; Prévalence

English Title: Prevalence of extended spectrum beta lactamases producing enterobacteria isolated from blood cultures on African continent and the involved genes in ESBL strains: literature review

English Abstract

Introduction: Extended-spectrum beta-lactamases producing Enterobacteria have been found worldwide. Surveillance studies are present in Europe, America, and Asia, but in Africa, there has been no research summary showing prevalence and distribution of extended-spectrum beta-lactamases on this continent.

Aim: This literature review aims to describe the prevalence of Extended-spectrum betalactamases producing Enterobacteria (ESBL-E) isolated from blood cultures in Africa and the involved ESBL genes in resistance.

Method: A literature search was performed in PubMed. Published articles in the field between 1996 and 2014 were reviewed and read in full text in order to observe the interest and relevance of the publication. In our context, articles that were relevant were assessed and included in the study.

Results: Prevalence of ESBL-E in hospitalized patients and in communities varies largely between countries and often can reach up to 77.8%. Several types of samples were studied to estimate prevalence of ESBL-E, but the particular case of blood cultures is really limited. ESBLs (class A and D) and plasmid-encoded AmpC (pAmpC) have regularly been found, CTX-M-15 gene of the class A is predominant in Africa

Conclusion: Extended-spectrum beta-lactamases producing Enterobacteria in hospital and communities areas are common around in Africa. Majority of studies were conducted in the North and in the East, leaving almost empty on other parts of the continent.

Keywords: Africa; Blood culture; Enterobacteria; Extended spectrum beta-lactamases; Prevalence