Analyse de la diversité génétique de la race bovine Bororo (Wodaabé) du Niger à l’aide de marqueurs microsatellites

Abstract

La diversité génétique de 48 individus de la race bovine Bororo du Niger provenant de trois populations a été étudiée à l’aide d’un panel de 27 marqueurs microsatellites. Un total de 201 allèles différents a été détecté sur les 27 loci explorés. Le nombre d’allèles observés (Na) par locus varie de 2 (ETH152 et SPS115) à 10 (TGLA53) avec une moyenne de 7,4 allèles observés par locus. Les taux d’hétérozygoties observés étaient compris entre 0,25 (ETH3) et 0,94 (BM2113) avec des valeurs moyennes par population supérieures à 0,63. En dépit d’un faible déficit en hétérozygotes observé, l’ensemble de la population évolue sous l’équilibre de Hardy-Weinberg. Cependant, la différenciation génétique entre ces trois populations est très faible avec un taux global de F_ST de 0,035 indiquant que 3,5% de la variation totale observée est liée aux différences entre populations. Cette situation est à mettre sur le compte d’un flux génique important (Nm>5,7%) entre ces trois populations en relation avec le mode de gestion des troupeaux. A long terme, ce flux de gênes important pourrait altérer la diversité génétique des zébus bororo dans ces trois localités du Niger.

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Mots clés: Zébu Bororo, marqueurs microsatellites, diversité génétique, Niger

English Title: Molecular analysis of genetic diversity of Niger Bororo (Wodaabé) cattle breed using microsatellites markers

English Abstract

Genetic diversity of 48 Niger Bororo individuals from three populations have been assessed using a panel of 27 microsatellite markers. A total of 201 different alleles were generated on the 27 loci explored. The number of observed alleles (Na) per locus ranged from 2 (ETH152 and SPS115) to 10 (TGLA53) with an average of 7.4 observed alleles per locus. Observed heterozygosity values ranged between 0.25 (ETH3) and  0.94 (BM2113). The overall mean observed heterozygosity value was more than 0.63. Despite a moderate heterozygote deficiency, the whole population did not deviate significantly from Hardy-Weinberg equilibrium. However, genetic differentiation between these three populations was low (3.5%). This situation is attributable to a significant gene flow (Nm> 5.7%) between populations in relation to the herd management system. In the long term, this important gene flow could alter the genetic diversity of zebu Bororo in these three areas of Niger.

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Keywords: Bororo cattle, microsatellite markers, genetic diversity, Niger