Bacilles Gram négatifs isolées à l’examen des prélèvements pulmonaires en milieu hospitalier à Niamey (Niger): recherche épidémiologique et thérapeutique

Abstract

L’incidence des bacilles à Gram-négatifs dans les affections pulmonaires de plus en plus importante, impose une prise de conscience des autorités sanitaires et l'élaboration de mesures efficaces de prévention et de contrôle. L’objectif était de déterminer, les caractéristiques épidémiologiques et thérapeutiques, des infections dues aux bacilles Gram négatifs, isolés des prélèvements pulmonaires des patients consultés. Il s’agit d’une étude prospective transversale, réalisée en milieu hospitalier à Niamey, du 1^er octobre 2013 au 30 septembre 2016. La prévalence de l’infection était de 21,55% dans la population d’étude. Elle était communautaire dans 95,74%. La toux représentait 90,22%. Les tuberculeux étaient les plus touchés (27,65%), suivi des tabagiques (23,40%). L’examen bactériologique a permis d’isoler 49 souches dont 28,57% étaient des bacilles entériques (Klebsiella penumoniae, Enterbacter cloacae, Escherichia coli, Serratia odorifera, Yersinia pseudotuberculosis, Klebsiella oxytoca). Dans 71,43% il s’agissait d’autres bacilles (Stenotrophomonas maltophilia, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Haemophilus influenzae). La sensibilité des germes aux antibiotiques courants était faible: la clotrimaxazole de 12/49 souches, l’amoxicilline de 5/16 souches, la ticarcilline de 12/44 souches. Cependant, l’infection touche plusieurs couches socioprofessionnelles, avec des prévalences plus remarquables avec certains facteurs de risques. La nétilmicine a été la molécule d’antibiotique vis-à-vis de laquelle les souches de bactéries ont présenté une plus forte sensibilité. Une bonne connaissance de l'écologie bactérienne pourrait améliorer la prise en charge des pathologies pulmonaires, grâce à des données de bases et à leur mise à jour régulière.

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Mots clés: Bacille Gram-négatif, poumon, épidémiologie, antibiogramme, Niamey

English Title: Gram negative rods isolated by examination of pulmonary samples in national hospital in Niamey (Niger): Epidemiological and therapeutic research

English Abstract

The incidence of Gram-negative rods is increasing in pulmonary diseases and requires awareness of health authorities and the development of effective prevention and control measures. The objective was to determine the epidemiological and therapeutic characteristics of infections due to Gram-negative bacilli isolated from the pulmonary samples of patients consulted. This is a prospective cross-sectional study carried out in hospitals in Niamey from 1^st October 2013 to 30^th September 2016. The prevalence was 21.55% in the study population. It was Community infection in 95.74%. Cough was 90.22% the most frequent clinical sign. The tuberculosis patients were the most represented (27.65%), followed by tobacco (23.40%). Bacteriological examination allowed to isolate 49 Gram-negative bacilli strains including in 28.57% enteric (Klebsiella penumoniae, Enterbacter cloacae, Escherichia coli, Serratia odorifera, Yersinia pseudotuberculosis, Klebsiella oxytoca). Other bacteria were found in 71.43% (Stenotrophomonas maltophilia, Acinetobacte rbaumannii, Pseudomonas aeruginosa, Haemophilus influenzae). The sensitivity of germs to most usual antibiotics was reduced. Thus for clotrimaxazole of 12/49 strains, amoxicillin of 5/16 strains, ticarcillin of 12/44 strains. However, the infection affects several socio-professional groups, with more prevalent of some risk factors. Netilmicin was the antibiotic molecule against which strains of bacteria exhibited higher sensitivity. A good knowledge of bacterial ecology could improve with treatment baseline data and regular local updating.

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Keywords: Gram negative rods, lung, epidemiology, antibiogram, Niamey