Identification of wild and cultivated yam (dioscorea sp) species using isozyme markers

Abstract

Using acrylamide gel electrophoresis a collection of both wild and cultivated species of yam originated from some west and central African countries was analysed to study isoenzymatic variability in four enzyme systems (6-Phosphogluconate Dehydrogenase,
phosphoglucomutase, phosphoglucoisomerase, shikimate dehydro-genase) and to assess the potential of their diverse isozymes patterns in species identification and classification.
Polymorphism was observed in all the enzyme systems studied and a total of 64 electromorphs and 43 bands (isozymes) of different frequency and variability patterns were
recorded. Combinations of banding patterns revealed an important polymorphism within
the sample analysed. Numerous patterns were found associated with some species (or
species groups) and in cluster analysis (UPGMA - Unweighted Pair-Group Method with
Arithmetic Average), the species reported morphologically or genetically close were grouped
as expected. The combination of the four systems used was found as a practical tool for
assessing diversity in yam germplasm, and identifying wild and cultivated Dioscorea
species. Une collection d\'ignames cultivées et sauvages originaires d\'Afrique de l\'Ouest et du Centre a été analysée au moyen d\'électrophorèse sur gel d\'acrylamide pour étudier la variabilité isozymique de quatre systèmes enzymatiques (6-Phosphogluconate Dehydrogenase, phosphoglucomutase, phosphoglucoisomerase, shikimate dehydro-genase) et évaluer la capacité de leurs diverses isozymes à identifier et classer différentes espèces d\'ignames. Un important polymorphisme est observé pour tous les systèmes enzymatiques utilisés. Au total 64 profils et 43 bandes de différentes fréquences sont bservées. La combinaison des différents profils a révélé un important polymorphisme dans la collection étudiée. De nombreux profils sont associés à des espèces (ou groupe d\'espèces) et dans une classification ascendante hiérarchique (CAH) les espèces connues comme morphologiquement et /ou génétiquement proches sont classées ensemble comme prévu. Pris ensemble, les quatre systèmes enzymatiques utilisés, sont apparus très efficaces pour l\'évaluation de la diversité génétique, l\'identification et la classification des espèces dans une collection d\'ignames (Dioscorea spp.).

Keywords: Dioscorea, genetic diversity, isozymes, species identification, yams.Dioscorea, diversité génétique, isozymes, identification d\'espèces, ignames

Annales des Sciences Agronomiques du Bénin Vol. 10 (1) 2008: pp. 1-16