Detection Et Caracterisation Des Bacteries Phytopathogenes Transmises Par Les Semences Du Riz Au Burkina Faso

Abstract

Douze échantillons de riz provenant de différentes régions du Burkina Faso ont été testés en vue de faire un inventaire des bactéries phytopathogènes transmises par les semences du riz. La méthode de détection en milieu liquide (Liquid assay) utilisée à l\'Institut Danois de Pathologie de Semences a été adoptée pour l\'isolement des bactéries. Des observations sur la fluorescence, la coloration et la forme des colonies en comparaison avec les bactéries de références ont été faites pour le choix des colonies suspectes. Le profil biochimique des colonies choisies a été utilisé pour l\'identification des bactéries au niveau de l\'espèce. Cette identité a été confirmée par les tests de pathogénie sur les plantules de riz. 92 % des échantillons de semences testées ont été infestées par les bactéries. Acidovorax avenae subsp. avenae ainsi que Xanthomonas oryzae pv. oryzae ont été chacune détectées dans 50 % des échantillons et Burkholderia Glumae dans 16,66 %. 52 % des bactéries identifiées se rapportent à Acidovorax avenae subsp. avenae, 35 % à Xanthomonas oryzae pv. oryzae et 13 % à Burkholderia glumae. Pseudomonas fuscovaginae et Pseudomonas syringae pv syringae n\'ont pas été rencontrés dans les échantillons étudiés.
Twelve seed samples of rice from various localities of Burkina Faso were screened for the presence of seed-transmitted plant pathogenic bacteria. The liquid assay used at the Danish Government Institute of Seed Pathology for Developping Countries was the method used for the extraction of bacteria. The observation of the fluorescence on King\'s B medium, the colour and colonies morphology in comparison with the reference were the methods used for the choice of suspected bacteria. Identification of colonies was performed on biochemical characteristic and pathogenicity tests. 92 % percent of seed samples tested were infected by bacteria. Acidovorax avenae subsp.avenae as well as Xanthomonas oryzae pv. oryzae were each detected in 50 % of seed samples and
Burkholderia glumae in 16.66 %. 52 % of bacteria belong to Acidovorax avenae subsp. avenae, 35 % to Xanthomonas oryzae pv. oryzae and 13 % to Burkholderia glumae. Pseudomonas fuscovaginae and Pseudomonas syringae pv syringae were not detected in the seed samples tested.
Keywords: Bactéries, détection, semences, riz, Burkina Faso; Bacteria, detection, seeds, rice, Burkina Faso.

Agronomie Africaine Vol. 16 (2) 2004: pp. 9-17