Incidence moleculaire et distribution des virus associes a la Mosaique Africaine du Manioc au Sud-Kivu en Republique Democratique du Congo

Abstract

La maladie de la mosaïque du manioc (CMD) est une maladie redoutable des systèmes de production de manioc (Manihot esculenta Crantz) en Afrique subsaharienne. L’objectif de cette étude était d’établir les virus associés au CMD et leur distribution spatio-temporelle dans la province du Sud-Kivu en République démocratique du Congo. Au total, 590 échantillons de feuilles de manioc ont été collectés entre novembre 2020 et Mars 2022 et analysés au laboratoire à l’aide de méthodes moléculaires. Les résultats ont montré que diverses souches virales (African Cassava Mosaic Virus (ACMV), East African Cassava Mosaic Virus (EACMV), ACMV+EACMV-UG, EACMCV et souches non spécifiées) étaient largement répandues dans le Sud-Kivu. La souche EACMV-UG était répandue dans tous les territoires de la province du Sud-Kivu, tandis que la souche camerounaise (EACMCV) n’a été trouvée que dans le territoire de Kalehe (2%). Il y avait une infection mixte (ACMV+EACMV-UG), bien qu’à des niveaux faibles, passant de 2,3 % en 2020 à 3 % en 2022. Tous les territoires étudiés présentaient une grande diversité de virus, à l’exception de celui d’Uvira, qui n’avait que l’EACMV-UG. Les virus ACMV étaient les plus abondants, suivis par l’EACMV-UG, dans la région étudiée. Une forte augmentation de la diversité virale s’est produite en 2020 et 2022, avec des taux passant de 33,07 à 57,5%.