Population studies of fungal plant pathogens: Perspectives for control with specific reference to grey leafspot

Abstract

Plant diseases hinder food production globally. Of the known crop plant pathogens, fungi are perhaps the most widely adapted organisms. For disease control, host resistance has been the main method used through major gene deployment. Equally important, has been the use of fungicides. Over the last two decades these two control strategies have been fraught with rapid resistance erosion commonly referred to as the “boom and burst cycle,”. This raises urgent concerns with regard to development of effective alternative strategies such as use of fungicides. The use of fungicides is an effective strategy but they are potential sources of pollution into the environment, pose serious health risks to humans and are uneconomical for low-resource farmers. In this article the potential of how improved disease management strategies embodied in integrated disease management (IDM) can be developed based on a clear understanding of the pathosystem is discussed. We demonstrate that population and molecular genetics can be used to define pathosystems, estimate the evolutionary responsiveness of pathogens and from the data, design appropriate durable control methods. Various population and molecular genetic methodologies are described and how they can be incorporated into standard pathogen characterisation studies. Using grey leaf spot of maize (Cercospora zeae-maydis) as a case study, we show how these techniques can be used to generate information on genetic variability, providing for logical development of a durable IDM programme.

Key words: Cercospora zeae-maydis, disease management, genetic tools, molecular markers

RÉSUMÉ

Les maladies de plante entravent globalement la production de nourriture. Des pathogènes de plante connus, les champignons sont peut être les plus rependus organismes adaptés. Pour le contrôle de maladie, la résistance hôte a été la méthode principale utilisée à travers le déploiement de gène majeur. Egalement important, a été l'usage des fongicides. Pour plus de deux décennies ces deux stratégies de contrôle ont été angoissées avec une rapide érosion de résistance communément connu à nous comme “boom and burst cycle” (cycle de boom et d'explosion). Ceci soulève les inquiétudes urgentes avec respect au développement des stratégies alternatives effectives comme l'usage des fongicides. L'usage des fongicides est une stratégie effective mais ces fongicides sont des sources potentielles de pollution dans l'environnement, pose des risques sérieux de santé aux humains et ne sont pas économiques pour les fermiers de faibles ressources. Dans cet article le potentiel de comment les stratégies améliorées de gestion des maladies incarnées dans une gestion intégrée des maladies (IDM) peut être développé basé sur une compréhension claire du pathosystème est discutée. Nous démontrons que la population et les génétiques moléculaires peuvent être utilisés pour définir les pathosystèmes, estimer les non réponses évolutionnaires des pathogènes et à partir des données, concevoir des méthodes de contrôle durables. Diverses populations et méthodologies génétiques moléculaires sont décrites et comment elles peuvent être incorporées dans les études de caractérisation de pathogène standard. Utilisant la tache grise de feuille de maïs (Cercospora zeae-maydis) comme cas d'étude, nous montrons comment ces techniques peuvent être utilisées pour générer l'information sur la variabilité génétique, pourvoyant le développement logique d'un programme d'IDM durable.

Mots clés: Cercospora zeae-maydis, gestion de maladie, outils génétiques, indicateur moléculaire

African Crop Science Journal Vol.12(4) 2004: 327-342