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Assessment of genetic diversity of local varieties of cassava in tanzania using molecular markers
Abstract
Twenty four arbitrarily selected cassava (Manihot esculenta Crantz) landraces, supplied by the germplasm collections in Kibaha and Ukiriguru research stations of Tanzania, were analysed by two different molecular marker techniques. Genetic distances on the basis of RAPD (random amplified polymorphic DNA) revealed separate clustering of almost all coast region-derived varieties. Inter-sequence-tagged repeat (ISTR) analysis, the second method, reproduced the geographical segregation, though the effect was less pronounced. Two genotypes were found to be very similar with either method, indicating a possible double accession. There is high overall genetic variability of the cassava germplasm. However, the variability is non- homogenous; rather it represents varieties of the same geographical origin grouped together. These findings are useful in the rationalisation of sampling and management of germplasm collections.
Key words: DNA, genetics, Manihot esculenta
RÉSUMÉ
Vingt quatre variétés locales de manioc (Manihot esculenta Crantz) étaient arbitrairement sélectionnées dans la collection de germe plasme de la station de recherché d'Ikiriguru-Kibahade en Tanzanie. Elles étaient analysées par deux techniques de molécules marqueuses différentes. La distance génétique sur base de RAPD (Amplification Polymorphique de l'ADN) révéla une séparation en classe de presque toutes les variétés en provenance de la région côtière. La première méthode concernant les analyses des répétitions des inter-sequences marquées, la seconde méthode, réproduisa la ségrégation géographique, même si l'effet était moins prononcé. Deux génotypes étaient trouvés similaires par les deux methods, indiquant une possibilité d'une double accession. Il y a une variation génétique élévée de germeplasme de manioc. Cependant, la variabilité est non-homogène; mais représente les variétés de la même origine géographique groupées ensemble. Ces résultants sont très importants dans la rationalization de l'échantillonnage et gestion des collections des germeplasmes.
Mots clés: AND, génétiques, Manihot esculenta
African Crop Science Journal Vol.12(3) 2004: 171-188
Key words: DNA, genetics, Manihot esculenta
RÉSUMÉ
Vingt quatre variétés locales de manioc (Manihot esculenta Crantz) étaient arbitrairement sélectionnées dans la collection de germe plasme de la station de recherché d'Ikiriguru-Kibahade en Tanzanie. Elles étaient analysées par deux techniques de molécules marqueuses différentes. La distance génétique sur base de RAPD (Amplification Polymorphique de l'ADN) révéla une séparation en classe de presque toutes les variétés en provenance de la région côtière. La première méthode concernant les analyses des répétitions des inter-sequences marquées, la seconde méthode, réproduisa la ségrégation géographique, même si l'effet était moins prononcé. Deux génotypes étaient trouvés similaires par les deux methods, indiquant une possibilité d'une double accession. Il y a une variation génétique élévée de germeplasme de manioc. Cependant, la variabilité est non-homogène; mais représente les variétés de la même origine géographique groupées ensemble. Ces résultants sont très importants dans la rationalization de l'échantillonnage et gestion des collections des germeplasmes.
Mots clés: AND, génétiques, Manihot esculenta
African Crop Science Journal Vol.12(3) 2004: 171-188
