Genetic Variation in Banana Cultivar ‘Sukali Ndizi\' Grown in Different Regions of Uganda

Abstract

Banana is an important food and cash crop in Uganda. The crop displays wide diversity but the genetic relationship between and withing cultivars is largely unknown. A study was conducted to assess genetic relationships among ‘Sukali Ndizi\' clones collected from 16 different localities in Uganda using the random amplified polymorphic DNA (RAPD) and amplified fragment length polymorphism (AFLP) techniques. Thirty-four RAPD primers used singly and in combination produced 234 unambiguous bands. The RAPD primers produced identical banding patterns in all the samples and were, therefore, not useful in differentiating the clones. However, the 9 AFLP primer pairs produced 554 fragments, 17 of which were polymorphic. Genetic relationships were established from the AFLP data by cluster analysis. Two groups of clones were clearly defined. Clones from selected contiguous districts such as Lira and Soroti, Bushenyi and Kasese districts were highly similar. Other closely related clones were from disjunctive localities. The similarity of the clones in adjacent districts is attributed to local exchange of germplasm, while similarity of clones in non-contiguous districts is probably the result of more purposeful and selective transfer of planting material. In general, the observed clonal variation may be due to somatic mutations.


Key Words: AFLP, germplasm, Musa, primers, RAPD, somatic mutations, Uganda



Résumé
La banane est un important aliment et plante commerciale en Ouganda. La plante affiche une large diversité mais la relation génétique entre et avec les variétés est largement inconnue. Une étude était conduite pour évaluer les relations génétiques entre les clones «Sukali Ndizi» collectés dans 16 localités différentes de l\'Ouganda en utilisant un prélévement aléatoire polymorphique amplifié DNA (RAPD) et des techniques amplifiés de polymorphisme de longueur de fragment (AFLP). Trente quatre premiers RAPD utilisés séparement et en combinaison ont produit 234 bandes non ambigues. Les premiers RAPD ont produit des tendances identiques en bandes dans tous les échantillons et étaient, ainsi non utiles dans la differentiation des clones. Cependant, les premières paires d\'AFLP par l\'analyse de bouquet. Deux groupes des clones étaient clairement définis. Les clones des districts contigus sélectionnés tels que Lira et Soroti, Bushenyi et Kasese étaient fortement similaires. Les autres clones fortement apparentés étaient des localités disjointes. La similarité des clones des districts adjacents est attribué à l\'échange local des germoplasme, pendant que la similarité des clones dans les districts non-contigu est probablement le résultat d\'un transfert plus objectif et plus selectif du matériel de plantation. En général, la variation clonale observée peut être due aux mutations somatiques.


Mots Clés: AFLP, germoplasme, Musa, premiers, RAPD, mutations somatiques, Ouganda


(Af Crop Sci J 2003 Vol 11 No 2 pp.87-95)